Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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PDE6HQ13956 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PDE6HQ13956 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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PDE6HQ13956 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
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PDE6HQ13956 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PDE6HQ13956 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PDE6HQ13956 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PDE6HQ13956 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PDE6HQ13956 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PDE6HQ13956 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PDE6HQ13956 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PDE6HQ13956 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PDE6HQ13956 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PDE6HQ13956 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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