Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CBFBQ13951 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CBFBQ13951 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms