Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PICALMQ13492 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PICALMQ13492 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms