Protein–RNA interactions for Protein: Q13424

SNTA1, Alpha-1-syntrophin, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTA1Q13424 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SNTA1Q13424 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNTA1Q13424 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms