Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SRSF5Q13243 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SRSF5Q13243 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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