Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
NME3Q13232 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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NME3Q13232 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME3Q13232 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME3Q13232 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME3Q13232 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME3Q13232 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME3Q13232 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME3Q13232 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME3Q13232 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME3Q13232 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
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NME3Q13232 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
NME3Q13232 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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NME3Q13232 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME3Q13232 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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NME3Q13232 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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NME3Q13232 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
NME3Q13232 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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NME3Q13232 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
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NME3Q13232 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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NME3Q13232 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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NME3Q13232 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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NME3Q13232 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
NME3Q13232 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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NME3Q13232 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
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NME3Q13232 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
NME3Q13232 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
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