Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
PRDM2Q13029 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
PRDM2Q13029 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PRDM2Q13029 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
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