Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NFX1Q12986 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NFX1Q12986 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
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