Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CNTN1Q12860 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
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CNTN1Q12860 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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CNTN1Q12860 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
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CNTN1Q12860 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CNTN1Q12860 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
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