Protein–RNA interactions for Protein: Q12439

TY2A-OR1, Transposon Ty2-OR1 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY2A-OR1Q12439 SPO75YLL005C 2607 nt1.53□□□□□ -2.16
TY2A-OR1Q12439 IFH1YLR223C 3258 nt1.53□□□□□ -2.16
TY2A-OR1Q12439 YCR022CYCR022C 345 nt1.53□□□□□ -2.16
TY2A-OR1Q12439 ALY2YJL084C 3141 nt1.53□□□□□ -2.16
TY2A-OR1Q12439 YMR321CYMR321C 318 nt1.53□□□□□ -2.16
TY2A-OR1Q12439 AIM44YPL158C 2277 nt1.53□□□□□ -2.16
TY2A-OR1Q12439 NUP192YJL039C 5052 nt1.52□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 RPS25BYLR333C 327 nt1.52□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 YOR282WYOR282W 321 nt1.52□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 CAT8YMR280C 4302 nt1.52□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 GPG1YGL121C 381 nt1.51□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 YOR161W-BYOR161W-B 261 nt1.51□□□□□ -2.17
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TY2A-OR1Q12439 PBY1YBR094W 2262 nt1.51□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 IRA1YBR140C 9279 nt1.5□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 RPS27BYHR021C 249 nt1.5□□□□□ -2.17
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TY2A-OR1Q12439 YPL152W-AYPL152W-A 99 nt1.5□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 MMS4YBR098W 2076 nt1.5□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 SXM1YDR395W 2835 nt1.5□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 YDR521WYDR521W 336 nt1.49□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 YJL015CYJL015C 285 nt1.49□□□□□ -2.17
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TY2A-OR1Q12439 YOR218CYOR218C 420 nt1.49□□□□□ -2.17
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TY2A-OR1Q12439 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt1.48□□□□□ -2.17
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TY2A-OR1Q12439 SPO21YOL091W 1830 nt1.47□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 EST2YLR318W 2655 nt1.47□□□□□ -2.17
TY2A-OR1Q12439 YDL206WYDL206W 2289 nt1.46□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 PAN2YGL094C 3348 nt1.46□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 PMD1YER132C 5262 nt1.46□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 PDE2YOR360C 1581 nt1.46□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 AZF1YOR113W 2745 nt1.46□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 IES4YOR189W 351 nt1.45□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 YBR206WYBR206W 324 nt1.45□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 SWI4YER111C 3282 nt1.45□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 YLR422WYLR422W 5799 nt1.45□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 SBE22YHR103W 2559 nt1.45□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 FIG4YNL325C 2640 nt1.44□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 YLR120W-AYLR120W-A 102 nt1.44□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt1.43□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt1.43□□□□□ -2.18
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TY2A-OR1Q12439 SLD3YGL113W 2007 nt1.42□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 YGL052WYGL052W 306 nt1.42□□□□□ -2.18
TY2A-OR1Q12439 PFD1YJL179W 330 nt1.42□□□□□ -2.18
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TY2A-OR1Q12439 NUP145YGL092W 3954 nt1.4□□□□□ -2.19
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TY2A-OR1Q12439 YGL188C-AYGL188C-A 141 nt1.39□□□□□ -2.19
TY2A-OR1Q12439 CDC31YOR257W 486 nt1.39□□□□□ -2.19
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TY2A-OR1Q12439 CCH1YGR217W 6120 nt1.38□□□□□ -2.19
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TY2A-OR1Q12439 YDR366CYDR366C 399 nt1.36□□□□□ -2.19
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TY2A-OR1Q12439 SPC110YDR356W 2835 nt1.35□□□□□ -2.19
TY2A-OR1Q12439 SEC3YER008C 4011 nt1.35□□□□□ -2.19
TY2A-OR1Q12439 YLL020CYLL020C 306 nt1.35□□□□□ -2.19
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TY2A-OR1Q12439 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.35□□□□□ -2.19
TY2A-OR1Q12439 ROM2YLR371W 4071 nt1.35□□□□□ -2.19
TY2A-OR1Q12439 FIG2YCR089W 4830 nt1.35□□□□□ -2.19
TY2A-OR1Q12439 SMC1YFL008W 3678 nt1.33□□□□□ -2.2
TY2A-OR1Q12439 AHC1YOR023C 1701 nt1.33□□□□□ -2.2
TY2A-OR1Q12439 ECM12YHR021W-A 456 nt1.33□□□□□ -2.2
TY2A-OR1Q12439 WAR1YML076C 2835 nt1.33□□□□□ -2.2
TY2A-OR1Q12439 RRT15YLR162W-A 189 nt1.32□□□□□ -2.2
TY2A-OR1Q12439 MDS3YGL197W 4464 nt1.32□□□□□ -2.2
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TY2A-OR1Q12439 PET127YOR017W 2403 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2A-OR1Q12439 SSK2YNR031C 4740 nt1.29□□□□□ -2.2
TY2A-OR1Q12439 tF(GAA)QtF(GAA)Q 75 nt1.29□□□□□ -2.2
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