Protein–RNA interactions for Protein: Q12266

TY1A-BL, Transposon Ty1-BL Gag polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BLQ12266 ORC3YLL004W 1851 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 MMS1YPR164W 4224 nt2.6□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 YDL206WYDL206W 2289 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 ECM29YHL030W 5607 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 POL3YDL102W 3294 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 RGC1YPR115W 3252 nt2.59□□□□□ -1.99
TY1A-BLQ12266 YOR296WYOR296W 3870 nt2.59□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 MSB2YGR014W 3921 nt2.59□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 FIR1YER032W 2631 nt2.58□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 ASE1YOR058C 2658 nt2.58□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 TOM1YDR457W 9807 nt2.58□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 SMC6YLR383W 3345 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 ECM21YBL101C 3354 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 NFT1YKR103W 3657 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 YKL096C-BYKL096C-B 150 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt2.57□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 ILS1YBL076C 3219 nt2.56□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 YIL169CYIL169C 2988 nt2.56□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 VAS1YGR094W 3315 nt2.56□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 YML002WYML002W 2214 nt2.56□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 JSN1YJR091C 3276 nt2.55□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 FLO11YIR019C 4104 nt2.55□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 RAX2YLR084C 3663 nt2.55□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 RPO41YFL036W 4056 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 SVL3YPL032C 2478 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 SAP185YJL098W 3177 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 TAF2YCR042C 4224 nt2.54□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 NUP157YER105C 4176 nt2.53□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 TBS1YBR150C 3285 nt2.53□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 SLI15YBR156C 2097 nt2.53□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 PNC1YGL037C 651 nt2.53□□□□□ -2
TY1A-BLQ12266 BUB1YGR188C 3066 nt2.53□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 YGL063C-AYGL063C-A 150 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 BUD2YKL092C 3315 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 INP51YIL002C 2841 nt2.52□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 CBF2YGR140W 2871 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 LCL1YPL056C 306 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 RTP1YMR185W 2946 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 FRK1YPL141C 2598 nt2.51□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 MSH5YDL154W 2706 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 RSM22YKL155C 1887 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 NOP9YJL010C 2001 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 ADR1YDR216W 3972 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 SIN3YOL004W 4611 nt2.5□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 SLH1YGR271W 5904 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 RPA190YOR341W 4995 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 YLR149C-AYLR149C-A 87 nt2.48□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 CYR1YJL005W 6081 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 SCP160YJL080C 3669 nt2.47□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 CDC60YPL160W 3273 nt2.46□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 SEC21YNL287W 2808 nt2.46□□□□□ -2.01
TY1A-BLQ12266 YJR039WYJR039W 3366 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 SEC26YDR238C 2922 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 AXL1YPR122W 3627 nt2.46□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 AGC1YPR021C 2709 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 TIM9YEL020W-A 264 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 MRD1YPR112C 2664 nt2.45□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 SAP1YER047C 2694 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 YDR209CYDR209C 414 nt2.44□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 YPL216WYPL216W 3309 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 NUP100YKL068W 2880 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 YER172C-AYER172C-A 381 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 SRB8YCR081W 4284 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 MMS4YBR098W 2076 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 TOR1YJR066W 7413 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 POL5YEL055C 3069 nt2.43□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 YKL225WYKL225W 348 nt2.42□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 COA6YMR244C-A 315 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 CAF120YNL278W 3183 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 YGR027W-BYGR027W-B 5268 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 YLR227W-BYLR227W-B 5268 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 YPR158C-DYPR158C-D 5268 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 PRP8YHR165C 7242 nt2.41□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 VPS8YAL002W 3825 nt2.4□□□□□ -2.02
TY1A-BLQ12266 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 AMS1YGL156W 3252 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 SSN2YDR443C 4263 nt2.4□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 YEF3YLR249W 3135 nt2.39□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 SEC10YLR166C 2616 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 ESL2YKR096W 3588 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 UFD4YKL010C 4452 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 SEY1YOR165W 2331 nt2.38□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 BCK1YJL095W 4437 nt2.37□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 RSE1YML049C 4086 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 YLR041WYLR041W 321 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 RPS29AYLR388W 171 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 BNR1YIL159W 4128 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 CTR9YOL145C 3234 nt2.36□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 MBB1YJL199C 327 nt2.34□□□□□ -2.03
TY1A-BLQ12266 MET18YIL128W 3099 nt2.33□□□□□ -2.04
TY1A-BLQ12266 CHC1YGL206C 4962 nt2.33□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 13.9 ms