Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CKAP4Q07065 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CKAP4Q07065 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms