Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRKCDQ05655 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms