Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CNTN2Q02246 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CNTN2Q02246 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms