Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SPTBN1Q01082 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SPTBN1Q01082 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms