Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
EFNB1P98172 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
EFNB1P98172 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms