Protein–RNA interactions for Protein: P82279

CRB1, Protein crumbs homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRB1P82279 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CRB1P82279 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CRB1P82279 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRB1P82279 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRB1P82279 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRB1P82279 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRB1P82279 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRB1P82279 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CRB1P82279 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
CRB1P82279 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRB1P82279 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRB1P82279 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CRB1P82279 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CRB1P82279 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CRB1P82279 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
CRB1P82279 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CRB1P82279 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRB1P82279 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRB1P82279 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRB1P82279 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRB1P82279 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRB1P82279 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRB1P82279 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CRB1P82279 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
CRB1P82279 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRB1P82279 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRB1P82279 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CRB1P82279 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CRB1P82279 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms