Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
RPS29P62273 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
RPS29P62273 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
RPS29P62273 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
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