Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ELLP55199 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELLP55199 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELLP55199 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELLP55199 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELLP55199 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELLP55199 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELLP55199 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELLP55199 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELLP55199 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELLP55199 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ELLP55199 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ELLP55199 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ELLP55199 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ELLP55199 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms