Protein–RNA interactions for Protein: P55000

SLURP1, Secreted Ly-6/uPAR-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLURP1P55000 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLURP1P55000 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms