Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
ZNF138P52744 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms