Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB5CP51148 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms