Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ETV1P50549 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ETV1P50549 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ETV1P50549 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ETV1P50549 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ETV1P50549 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ETV1P50549 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
ETV1P50549 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ETV1P50549 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms