Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATMP50440 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATMP50440 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATMP50440 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
GATMP50440 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
GATMP50440 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
GATMP50440 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
GATMP50440 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATMP50440 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GATMP50440 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATMP50440 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATMP50440 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATMP50440 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATMP50440 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GATMP50440 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
GATMP50440 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATMP50440 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
GATMP50440 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
GATMP50440 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
GATMP50440 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GATMP50440 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATMP50440 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATMP50440 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATMP50440 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATMP50440 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATMP50440 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATMP50440 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATMP50440 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATMP50440 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATMP50440 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GATMP50440 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GATMP50440 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms