Protein–RNA interactions for Protein: P49760

CLK2, Dual specificity protein kinase CLK2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK2P49760 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLK2P49760 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLK2P49760 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLK2P49760 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK2P49760 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK2P49760 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK2P49760 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK2P49760 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK2P49760 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK2P49760 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK2P49760 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK2P49760 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK2P49760 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK2P49760 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLK2P49760 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLK2P49760 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms