Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TM4SF4P48230 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TM4SF4P48230 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms