Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GJA8P48165 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA8P48165 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA8P48165 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA8P48165 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA8P48165 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA8P48165 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA8P48165 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA8P48165 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GJA8P48165 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA8P48165 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA8P48165 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA8P48165 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
GJA8P48165 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA8P48165 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA8P48165 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA8P48165 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA8P48165 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA8P48165 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA8P48165 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA8P48165 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA8P48165 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GJA8P48165 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GJA8P48165 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GJA8P48165 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GJA8P48165 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GJA8P48165 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms