Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UTRNP46939 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UTRNP46939 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UTRNP46939 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UTRNP46939 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UTRNP46939 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
UTRNP46939 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UTRNP46939 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
UTRNP46939 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UTRNP46939 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
UTRNP46939 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTRNP46939 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UTRNP46939 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTRNP46939 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTRNP46939 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTRNP46939 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTRNP46939 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTRNP46939 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTRNP46939 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTRNP46939 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
UTRNP46939 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTRNP46939 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
UTRNP46939 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTRNP46939 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTRNP46939 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTRNP46939 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTRNP46939 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTRNP46939 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTRNP46939 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTRNP46939 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTRNP46939 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTRNP46939 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
UTRNP46939 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTRNP46939 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
UTRNP46939 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UTRNP46939 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UTRNP46939 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UTRNP46939 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UTRNP46939 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
UTRNP46939 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
UTRNP46939 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UTRNP46939 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
UTRNP46939 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UTRNP46939 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
UTRNP46939 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
UTRNP46939 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTRNP46939 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTRNP46939 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
UTRNP46939 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTRNP46939 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTRNP46939 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTRNP46939 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTRNP46939 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTRNP46939 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
UTRNP46939 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UTRNP46939 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UTRNP46939 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UTRNP46939 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms