Protein–RNA interactions for Protein: P36012

CSE4, Histone H3-like centromeric protein CSE4, yeastyeast

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CSE4P36012 ALK1YGL021W 2283 nt2.93□□□□□ -1.94
CSE4P36012 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt2.92□□□□□ -1.94
CSE4P36012 YDR239CYDR239C 2364 nt2.92□□□□□ -1.94
CSE4P36012 YCR095W-AYCR095W-A 159 nt2.92□□□□□ -1.94
CSE4P36012 YPR203WYPR203W 309 nt2.92□□□□□ -1.94
CSE4P36012 YCR038W-AYCR038W-A 126 nt2.91□□□□□ -1.94
CSE4P36012 REV3YPL167C 4515 nt2.91□□□□□ -1.94
CSE4P36012 ISW1YBR245C 3390 nt2.9□□□□□ -1.94
CSE4P36012 ESC1YMR219W 4977 nt2.9□□□□□ -1.95
CSE4P36012 COX12YLR038C 252 nt2.9□□□□□ -1.95
CSE4P36012 RPS29AYLR388W 171 nt2.9□□□□□ -1.95
CSE4P36012 FLO11YIR019C 4104 nt2.9□□□□□ -1.95
CSE4P36012 FAR11YNL127W 2862 nt2.89□□□□□ -1.95
CSE4P36012 YJL026C-AYJL026C-A 222 nt2.89□□□□□ -1.95
CSE4P36012 SVL3YPL032C 2478 nt2.88□□□□□ -1.95
CSE4P36012 TAO3YIL129C 7131 nt2.88□□□□□ -1.95
CSE4P36012 HMI1YOL095C 2121 nt2.88□□□□□ -1.95
CSE4P36012 YBR206WYBR206W 324 nt2.88□□□□□ -1.95
CSE4P36012 TRL1YJL087C 2484 nt2.87□□□□□ -1.95
CSE4P36012 UTP22YGR090W 3714 nt2.86□□□□□ -1.95
CSE4P36012 CHC1YGL206C 4962 nt2.86□□□□□ -1.95
CSE4P36012 snR61snR61 90 nt2.86□□□□□ -1.95
CSE4P36012 TUS1YLR425W 3924 nt2.86□□□□□ -1.95
CSE4P36012 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt2.85□□□□□ -1.95
CSE4P36012 TOP2YNL088W 4287 nt2.85□□□□□ -1.95
CSE4P36012 OST4YDL232W 111 nt2.85□□□□□ -1.95
CSE4P36012 GIP3YPL137C 3831 nt2.85□□□□□ -1.95
CSE4P36012 AGC1YPR021C 2709 nt2.85□□□□□ -1.95
CSE4P36012 TOR1YJR066W 7413 nt2.84□□□□□ -1.95
CSE4P36012 CMC4YMR194C-B 222 nt2.84□□□□□ -1.95
CSE4P36012 LCL1YPL056C 306 nt2.84□□□□□ -1.95
CSE4P36012 BUD2YKL092C 3315 nt2.84□□□□□ -1.96
CSE4P36012 YGR109W-BYGR109W-B 4644 nt2.83□□□□□ -1.96
CSE4P36012 RAV1YJR033C 4074 nt2.83□□□□□ -1.96
CSE4P36012 MLH1YMR167W 2310 nt2.83□□□□□ -1.96
CSE4P36012 PRP5YBR237W 2550 nt2.83□□□□□ -1.96
CSE4P36012 SAP185YJL098W 3177 nt2.83□□□□□ -1.96
CSE4P36012 PKH2YOL100W 3246 nt2.83□□□□□ -1.96
CSE4P36012 YOR019WYOR019W 2193 nt2.83□□□□□ -1.96
CSE4P36012 SYH1YPL105C 2550 nt2.82□□□□□ -1.96
CSE4P36012 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.82□□□□□ -1.96
CSE4P36012 YLR282CYLR282C 342 nt2.82□□□□□ -1.96
CSE4P36012 YNL211CYNL211C 261 nt2.82□□□□□ -1.96
CSE4P36012 TTI1YKL033W 3117 nt2.82□□□□□ -1.96
CSE4P36012 YEF3YLR249W 3135 nt2.82□□□□□ -1.96
CSE4P36012 CDC60YPL160W 3273 nt2.81□□□□□ -1.96
CSE4P36012 TFC3YAL001C 3483 nt2.81□□□□□ -1.96
CSE4P36012 YIL002W-AYIL002W-A 210 nt2.81□□□□□ -1.96
CSE4P36012 YMR175W-AYMR175W-A 195 nt2.81□□□□□ -1.96
CSE4P36012 CTR9YOL145C 3234 nt2.81□□□□□ -1.96
CSE4P36012 COG4YPR105C 2586 nt2.8□□□□□ -1.96
CSE4P36012 SBH1YER087C-B 249 nt2.8□□□□□ -1.96
CSE4P36012 DNF1YER166W 4716 nt2.8□□□□□ -1.96
CSE4P36012 YNL067W-BYNL067W-B 141 nt2.79□□□□□ -1.96
CSE4P36012 SLI15YBR156C 2097 nt2.78□□□□□ -1.96
CSE4P36012 RPL37BYDR500C 267 nt2.78□□□□□ -1.96
CSE4P36012 YKR075W-AYKR075W-A 270 nt2.78□□□□□ -1.96
CSE4P36012 UBP15YMR304W 3693 nt2.78□□□□□ -1.96
CSE4P36012 INO80YGL150C 4470 nt2.78□□□□□ -1.96
CSE4P36012 RTT107YHR154W 3213 nt2.77□□□□□ -1.97
CSE4P36012 PET309YLR067C 2898 nt2.77□□□□□ -1.97
CSE4P36012 APL1YJR005W 2103 nt2.77□□□□□ -1.97
CSE4P36012 KRE33YNL132W 3171 nt2.76□□□□□ -1.97
CSE4P36012 YLL054CYLL054C 2532 nt2.75□□□□□ -1.97
CSE4P36012 YNL144CYNL144C 2223 nt2.75□□□□□ -1.97
CSE4P36012 GYP5YPL249C 2685 nt2.75□□□□□ -1.97
CSE4P36012 CHS6YJL099W 2241 nt2.74□□□□□ -1.97
CSE4P36012 IRE1YHR079C 3348 nt2.74□□□□□ -1.97
CSE4P36012 SOM1YEL059C-A 225 nt2.73□□□□□ -1.97
CSE4P36012 SRB8YCR081W 4284 nt2.73□□□□□ -1.97
CSE4P36012 MDS3YGL197W 4464 nt2.73□□□□□ -1.97
CSE4P36012 VPS13YLL040C 9435 nt2.72□□□□□ -1.97
CSE4P36012 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt2.72□□□□□ -1.97
CSE4P36012 YDL118WYDL118W 381 nt2.72□□□□□ -1.97
CSE4P36012 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt2.71□□□□□ -1.98
CSE4P36012 HIR3YJR140C 4947 nt2.7□□□□□ -1.98
CSE4P36012 HSL1YKL101W 4557 nt2.69□□□□□ -1.98
CSE4P36012 LHS1YKL073W 2646 nt2.69□□□□□ -1.98
CSE4P36012 YGL182CYGL182C 324 nt2.69□□□□□ -1.98
CSE4P36012 ADR1YDR216W 3972 nt2.69□□□□□ -1.98
CSE4P36012 SPF1YEL031W 3648 nt2.69□□□□□ -1.98
CSE4P36012 FRK1YPL141C 2598 nt2.68□□□□□ -1.98
CSE4P36012 TIM9YEL020W-A 264 nt2.68□□□□□ -1.98
CSE4P36012 YDL206WYDL206W 2289 nt2.67□□□□□ -1.98
CSE4P36012 PSD2YGR170W 3417 nt2.67□□□□□ -1.98
CSE4P36012 RTT101YJL047C 2529 nt2.67□□□□□ -1.98
CSE4P36012 KIP1YBL063W 3336 nt2.67□□□□□ -1.98
CSE4P36012 KOG1YHR186C 4674 nt2.66□□□□□ -1.98
CSE4P36012 YAL067W-AYAL067W-A 228 nt2.66□□□□□ -1.98
CSE4P36012 SSD1YDR293C 3753 nt2.66□□□□□ -1.98
CSE4P36012 IRC8YJL051W 2469 nt2.65□□□□□ -1.98
CSE4P36012 YGL041C-BYGL041C-B 183 nt2.65□□□□□ -1.99
CSE4P36012 ANS1YHR126C 480 nt2.64□□□□□ -1.99
CSE4P36012 IRA2YOL081W 9240 nt2.64□□□□□ -1.99
CSE4P36012 BRE1YDL074C 2103 nt2.62□□□□□ -1.99
CSE4P36012 SGM1YJR134C 2124 nt2.62□□□□□ -1.99
CSE4P36012 UFD2YDL190C 2886 nt2.62□□□□□ -1.99
CSE4P36012 SPO24YPR036W-A 204 nt2.62□□□□□ -1.99
CSE4P36012 UFD4YKL010C 4452 nt2.62□□□□□ -1.99
CSE4P36012 IST2YBR086C 2841 nt2.62□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.9 ms