Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ACTN2P35609 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ACTN2P35609 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ACTN2P35609 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ACTN2P35609 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ACTN2P35609 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ACTN2P35609 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms