Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SFTPDP35247 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SFTPDP35247 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms