Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CD40LGP29965 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CD40LGP29965 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms