Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GJB2P29033 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GJB2P29033 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GJB2P29033 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GJB2P29033 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB2P29033 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB2P29033 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB2P29033 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB2P29033 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB2P29033 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB2P29033 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GJB2P29033 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GJB2P29033 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GJB2P29033 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GJB2P29033 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms