Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PEX2P28328 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
PEX2P28328 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
PEX2P28328 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX2P28328 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX2P28328 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX2P28328 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX2P28328 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX2P28328 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
PEX2P28328 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms