Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
HLA-DMAP28067 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
HLA-DMAP28067 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms