Protein–RNA interactions for Protein: P27797

CALR, Calreticulin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALRP27797 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CALRP27797 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CALRP27797 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CALRP27797 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CALRP27797 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 351.6 ms