Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PTAFRP25105 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms