Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP2B4P23634 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP2B4P23634 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms