Protein–RNA interactions for Protein: P18433

PTPRA, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, humanhuman

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Length 802 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRAP18433 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PTPRAP18433 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
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