Protein–RNA interactions for Protein: P11387

TOP1, DNA topoisomerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP1P11387 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TOP1P11387 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOP1P11387 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TOP1P11387 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TOP1P11387 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TOP1P11387 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TOP1P11387 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TOP1P11387 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TOP1P11387 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms