Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RARBP10826 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RARBP10826 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
RARBP10826 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
RARBP10826 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RARBP10826 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
RARBP10826 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARBP10826 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARBP10826 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARBP10826 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARBP10826 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARBP10826 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RARBP10826 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
RARBP10826 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARBP10826 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARBP10826 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARBP10826 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARBP10826 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RARBP10826 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RARBP10826 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RARBP10826 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RARBP10826 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RARBP10826 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms