Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
HKR1P10072 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
HKR1P10072 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
HKR1P10072 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms