Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FAM228BP0C875 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FAM228BP0C875 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms