Protein–RNA interactions for Protein: P09630

HOXC6, Homeobox protein Hox-C6, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC6P09630 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXC6P09630 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXC6P09630 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms