Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NGFRP08138 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NGFRP08138 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NGFRP08138 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NGFRP08138 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NGFRP08138 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms