Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRPF40AO75400 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRPF40AO75400 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms