Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
VAMP4O75379 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAMP4O75379 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAMP4O75379 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAMP4O75379 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAMP4O75379 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAMP4O75379 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAMP4O75379 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
VAMP4O75379 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms