Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMARCA5O60264 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMARCA5O60264 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms