Protein–RNA interactions for Protein: O43920

NDUFS5, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFS5O43920 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.53
NDUFS5O43920 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.7□□□□□ -0.54
NDUFS5O43920 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms