Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CTIFO43310 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CTIFO43310 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTIFO43310 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CTIFO43310 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CTIFO43310 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CTIFO43310 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CTIFO43310 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CTIFO43310 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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